认识RBS序列
在基因工程中,可能需要增加或减少一种特定蛋白质的表达量。为此,需要找到一种方法,可以调节一个特定的基因,使其表达量发生变化。其中,RBS序列就是实现这一目的的重要组成部分。
什么是RBS序列?
RBS序列,又称为翻译起始点(ribosome binding site),是存在于RNA序列中的一个重要区域。这个区域位于mRNA序列的5'端,紧随起始密码子之后。RBS序列和起始密码子之间的n个碱基序列被称作导引序列(leader sequence),它们共同组成了翻译起始复合物(ribosome initiation complex)。
RBS序列的作用
RBS序列的主要作用是协助翻译起始复合物正确地识别起始密码子,并将转录后的mRNA序列翻译为相应的蛋白质。在翻译起始复合物中,机械梭织蛋白(ribosome)结合RBS序列,同时匹配起始密码子。这个过程的顺序和精确性决定了蛋白质表达量的高低、质量等参数。因此,确定合适的RBS序列,是影响蛋白质表达的重要因素之一。
如何选择RBS序列?
在基因工程中,选择合适的RBS序列是非常重要的。在很多实验中,需要将一种外源蛋白质表达到某一特定表达量水平,或者将某一内源蛋白质表达提高到较高水平。对于这些需求,可以根据一些实验数据和基因结构信息,选择适合的RBS序列。基本原则就是要将选择的RBS序列与特定蛋白质的起始密码子相配对,以确保高效而正确的翻译起始。
一些研究表明,不同的RBS序列可以显著地影响蛋白质表达水平。因此,选择合适的RBS序列非常重要。不过,对于一些比较简单的实验和科研项目,可以采用一些公认比较高效的RBS序列。例如,BBa_B0033、BBa_B0064是含有强效RBS序列的常用登革热基因。BBa_B0034是一种适用于E.coli的通用RBS序列,而BBa_B0032则是一种常用的微弱RBS序列。
总的来说,选择合适的RBS序列需要考虑不同的实验条件、具体的表达需求以及基因序列本身的特点等多个因素。只有选择合适、高效的RBS序列,才能更好地实现高水平的蛋白表达。